bio-metagenomics-visualization

Name: bio-metagenomics-visualization
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Visualize metagenomic profiles using R (phyloseq, microbiome) and Python (matplotlib, seaborn). Create stacked bar plots, heatmaps, PCA plots, and diversity analyses. Use when creating publication-quality figures from MetaPhlAn, Bracken, or other taxonomic profiling output.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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#python

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Version Compatibility

Reference examples tested with: MetaPhlAn 4.1+, ggplot2 3.5+, matplotlib 3.8+, pandas 2.2+, phyloseq 1.46+, scanpy 1.10+, scikit-learn 1.4+, scipy 1.12+, seaborn 0.13+, vegan 2.6+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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