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bio-microbiome-diversity-analysis

Desenvolvimento Autor: bg-szy

Alpha and beta diversity analysis for microbiome data. Calculate within-sample richness, evenness, and between-sample dissimilarity with phyloseq and vegan. Use when comparing community composition across samples or testing for group differences in microbiome structure.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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#test

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Version Compatibility

Reference examples tested with: R stats (base), ggplot2 3.5+, phyloseq 1.46+, scanpy 1.10+, vegan 2.6+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Diversity Analysis

**"Compare microbial diversity a

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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