bio-pathway-go-enrichment

Name: bio-pathway-go-enrichment
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Gene Ontology over-representation analysis using clusterProfiler enrichGO. Use when identifying biological functions enriched in a gene list from differential expression or other analyses. Supports all three ontologies (BP, MF, CC), multiple ID types, and customizable statistical thresholds.

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Atualizado há 18 dias

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Version Compatibility

Reference examples tested with: R stats (base), clusterProfiler 4.10+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

GO Over-Representation Analysis

When to Use ORA vs GSEA

| Scenario | Method | Wh

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