bio-pathway-reactome

Name: bio-pathway-reactome
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Reactome pathway enrichment using ReactomePA package. Use when analyzing gene lists against Reactome's curated peer-reviewed pathway database. Performs over-representation analysis and GSEA with visualization and pathway hierarchy exploration.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: R stats (base), ReactomePA 1.46+, clusterProfiler 4.10+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Reactome Pathway Enrichment

When to Use Reactome

| Scenario |

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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