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bio-pdb-structure-modification

Design e Frontend Autor: bg-szy

Modify protein structures using Biopython Bio.PDB. Use when transforming coordinates, removing atoms or residues, adding new entities, modifying B-factors and occupancies, or building structures programmatically.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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#python

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Version Compatibility

Reference examples tested with: BioPython 1.83+, numpy 1.26+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Structure Modification

"Extract a chain from a PDB file" → Remove/add atoms, residu

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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