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bio-phasing-imputation-genotype-imputation

Dados e Análise Autor: bg-szy

Impute missing genotypes using reference panels with Beagle or Minimac4. Use when increasing variant density for GWAS, harmonizing data across genotyping platforms, or inferring variants not directly typed in array data.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

All Rights Reserved.

#

This code is proprietary and confidential.

Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

-->

Genotype Imputation

Beagle Imputation

# Basic imputation
java -jar beagle.jar \
    gt=study.vcf.gz \
    ref=reference_panel.vcf.gz \
 

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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