bio-phasing-imputation-haplotype-phasing

Name: bio-phasing-imputation-haplotype-phasing
Author: bg-szy

Design e Frontend

Autor: bg-szy

Phase genotypes into haplotypes using Beagle or SHAPEIT. Resolves which alleles are inherited together on each chromosome. Use when preparing VCF files for imputation, HLA typing, or population genetic analyses requiring phased haplotypes.

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Atualizado há 4 meses

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Reference examples tested with: bcftools 1.19+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Haplotype Phasing

"Phase my genotypes into haplotypes" -> Resolve which alleles are inherited together on each ch

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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