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bio-phasing-imputation-imputation-qc

Dados e Análise Autor: bg-szy

Quality control of phasing and imputation results. Filter by INFO scores, assess accuracy, and prepare imputed data for downstream analysis. Use when filtering low-quality imputed variants or validating imputation accuracy before GWAS.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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Imputation QC

Extract INFO Scores

# Beagle DR2 (dosage R-squared)
bcftools query -f '%CHROM\t%POS\t%ID\t%REF\t%ALT\t%INFO/DR2\t%INFO/AF\

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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