bio-phasing-imputation-imputation-qc

Name: bio-phasing-imputation-imputation-qc
Rating: 5 (2 reviews)
Author: bg-szy

Quality control of phasing and imputation results. Filter by INFO scores, assess accuracy, and prepare imputed data for downstream analysis. Use when filtering low-quality imputed variants or validating imputation accuracy before GWAS.

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Atualizado mês passado

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Reference examples tested with: bcftools 1.19+, matplotlib 3.8+, numpy 1.26+, pandas 2.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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