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bio-phylo-distance-calculations

Design e Frontend Autor: bg-szy

Compute evolutionary distances and build phylogenetic trees using Biopython Bio.Phylo.TreeConstruction. Use when creating distance matrices from alignments, building NJ/UPGMA trees, generating bootstrap consensus, or needing quick exploratory phylogenies before running full ML analysis.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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#python

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Version Compatibility

Reference examples tested with: BioPython 1.83+, NCBI BLAST+ 2.15+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Distance Calculations and Tree Building

**"Build a phylogenetic tree from my alig

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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