bio-phylo-modern-tree-inference

Name: bio-phylo-modern-tree-inference
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Build maximum likelihood phylogenetic trees using IQ-TREE2 and RAxML-NG with expert model selection, branch support assessment, and topology testing. Use when inferring publication-quality ML trees, selecting substitution models, interpreting bootstrap and concordance factor support, or running partitioned phylogenomic analyses.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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#test

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Version Compatibility

Reference examples tested with: IQ-TREE 2.2+, RAxML-NG 1.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: iqtree2 --version then iqtree2 --help to confirm flags
CLI: raxml-ng --version then raxml-ng --help to confirm flags

If commands fail, introspect the installed version and adapt flags rather than retrying.

Modern ML Tree Inference

"Infer a maximum likelihood tree from my alignment" -> Build publication-qu

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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