bio-population-genetics-selection-statistics

Name: bio-population-genetics-selection-statistics
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Detect signatures of natural selection using Fst, Tajima's D, iHS, XP-EHH, and other selection statistics. Calculate population differentiation, test for departures from neutrality, and identify selective sweeps with scikit-allel and vcftools. Use when computing selection signatures like Fst or Tajima's D.

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Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: STAR 2.7.11+, matplotlib 3.8+, numpy 1.26+, scipy 1.12+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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