Bowtie2 Alignment
Build Index
# Build index from reference FASTA
bowtie2-build reference.fa reference_index
# With threads (faster)
bow
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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<!--
# COPYRIGHT NOTICE
# This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.
# Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>
# All Rights Reserved.
#
# This code is proprietary and confidential.
# Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.
#
# Provenance: Authenticated by MD BABU MIA
-->
bio-read-alignment-bowtie2-alignment
Align short reads using Bowtie2 with local or end-to-end modes. Supports gapped alignment. Use when aligning ChIP-seq, ATAC-seq, or when flexible alignment modes are needed.
1estrelas
Atualizado há 12 dias
Como adicionar
/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
Para o autor da skill
Cole no README do seu repo
Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.
[](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-read-alignment-bowtie2-alignment?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)
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