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bio-read-alignment-hisat2-alignment

Design e Frontend Autor: bg-szy

Align RNA-seq reads with HISAT2, a memory-efficient splice-aware aligner. Use when STAR's memory requirements are too high or for general RNA-seq alignment.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

All Rights Reserved.

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This code is proprietary and confidential.

Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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HISAT2 RNA-seq Alignment

Build Index

# Basic index (no annotation)
hisat2-build -p 8 reference.fa hisat2_index

# Index with splice site

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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