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bio-read-alignment-star-alignment

Align RNA-seq reads with STAR (Spliced Transcripts Alignment to a Reference). Supports two-pass mode for novel splice junction discovery. Use when aligning RNA-seq data requiring splice-aware alignment.

2estrelas
Atualizado há 4 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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Version Compatibility

Reference examples tested with: STAR 2.7.11+, Subread 2.0+, fastp 0.23+, kallisto 0.50+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

STAR RNA-seq Alignment

"Align RNA-seq reads with STAR" -> Map RNA-seq re

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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