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bio-rna-structure-ncrna-search

Desenvolvimento Autor: bg-szy

Searches for non-coding RNA homologs and classifies RNA families using Infernal covariance model searches against the Rfam database. Identifies structured RNAs by sequence and secondary structure conservation. Use when querying sequences against Rfam, building custom covariance models for novel RNA families, or classifying non-coding transcripts by family.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: BioPython 1.83+, Infernal 1.1+, pandas 2.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

ncRNA Sea

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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