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bio-rnaseq-qc

RNA-seq specific quality control including rRNA contamination detection, strandedness verification, gene body coverage, and transcript integrity metrics. Use when validating RNA-seq libraries before differential expression analysis.

2estrelas
Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Reference examples tested with: NCBI BLAST+ 2.15+, numpy 1.26+, picard 3.1+, pysam 0.22+, samtools 1.19+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rathe

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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