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Perform differential expression analysis of miRNAs between conditions using DESeq2 or edgeR with small RNA-specific considerations. Use when identifying miRNAs that change between treatment groups, disease states, or developmental stages.
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Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>
All Rights Reserved.
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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA
-->
Differential miRNA Expression
Load miRNA Count Data
library(DESeq2)
# Load miRge3 or miRDeep2 counts
counts <- read.csv('miR.Counts.csv',
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