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bio-splicing-pipeline

Dados e Análise Autor: bg-szy

End-to-end alternative splicing analysis from FASTQ to differential splicing results. Aligns with STAR 2-pass mode, performs junction QC, runs rMATS-turbo for differential analysis, and generates sashimi visualizations. Use when performing comprehensive splicing analysis from raw RNA-seq data.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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Alternative Splicing Analysis Pipeline

Complete workflow from raw RNA-seq to differential splicing results.

Pipeline Overview

FASTQ → Read 

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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