bio-substructure-search

Name: bio-substructure-search
Author: bg-szy

Design e Frontend

Autor: bg-szy

Searches molecular libraries for substructure matches using SMARTS patterns with explicit handling of recursive SMARTS, ring membership, aromaticity dialect, vector binding, atom map indices, and reactive/PAINS/REOS/Brenk/Aldridge filter catalogs. Use when filtering compounds by pharmacophore features, functional groups, scaffold matches, or screening for assay-interference / structural alerts.

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Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: RDKit 2024.09+. SMARTS dialect follows Daylight specification with RDKit extensions.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show rdkit then help(rdkit.Chem.MolFromSmarts) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Substructure Search

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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