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bio-systems-biology-gene-essentiality

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

Perform in silico gene knockout analysis and synthetic lethality screens using COBRApy single and double deletions. Predict essential genes and identify synthetic lethal pairs for drug target discovery. Use when identifying essential genes or finding synthetic lethal drug targets.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: COBRApy 0.29+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Gene Essentiality Analysis

"Predict which genes are essential for growth in my organism" -> Perfor

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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