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bio-systems-biology-model-curation

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

Validate, gap-fill, and curate genome-scale metabolic models using memote for quality scores and COBRApy for manual curation. Ensure models meet SBML standards and produce biologically meaningful predictions. Use when improving draft models or preparing models for publication.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Version Compatibility

Reference examples tested with: COBRApy 0.29+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Model Curation

**"Validate and improve

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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