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bio-temporal-genomics-circadian-rhythms

Desenvolvimento Autor: bg-szy

Detects circadian and ultradian rhythms in time-series omics data using CosinorPy cosinor models, MetaCycle (JTK_CYCLE, ARSER), and RAIN non-parametric tests. Fits cosine models to estimate phase and amplitude, tests rhythmicity significance at pre-specified periods. Use when testing for 24-hour or other known-period oscillations in circadian, feeding-fasting, or light-dark cycle experiments. Not

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Atualizado há 4 meses
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#ai #test

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Reference examples tested with: R stats (base), pandas 2.2+, statsmodels 0.14+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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