bio-temporal-genomics-temporal-grn

Name: bio-temporal-genomics-temporal-grn
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Infers dynamic gene regulatory networks from bulk time-series expression data using Granger causality (statsmodels), dynGENIE3 (Extra-Trees on ODE-derived expression derivatives), and dynamic Bayesian networks (bnlearn). Identifies time-delayed regulatory relationships and tracks network rewiring across conditions. Use when inferring causal regulatory relationships from bulk temporal expression da

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Version Compatibility

Reference examples tested with: numpy 1.26+, pandas 2.2+, statsmodels 0.14+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

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