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Call structural variants (SVs) from short-read sequencing using Manta, Delly, and LUMPY. Detects deletions, insertions, inversions, duplications, and translocations that are too large for standard SNV callers. Use when detecting structural variants from short-read data.
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
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Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>
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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA
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Structural Variant Calling (Short Reads)
Manta (Recommended)
# Configure Manta run (creates runWorkflow.py)
configManta.py \
--bam s
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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