bio-virtual-screening

Name: bio-virtual-screening
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Performs structure-based virtual screening using AutoDock Vina 1.2 for molecular docking. Prepares receptor PDBQT files, generates ligand conformers, defines binding site boxes, and ranks compounds by predicted binding affinity. Use when screening chemical libraries against a protein structure to find potential binders.

1estrelas

Atualizado há 18 dias

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Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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Version Compatibility

Reference examples tested with: AutoDock Vina 1.2+, RDKit 2024.03+, pandas 2.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Virtual Screening

**"Dock my compound library against a protein targ

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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