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bio-workflow-management-nextflow-pipelines

DevOps e Infra Autor: bg-szy

Create scalable, containerized bioinformatics pipelines with Nextflow DSL2 supporting Docker, Singularity, and cloud execution. Use when building portable pipelines with container support, running workflows on cloud platforms (AWS, Google Cloud), or leveraging nf-core community pipelines.

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Atualizado há 4 meses
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#ai #docker

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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

All Rights Reserved.

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This code is proprietary and confidential.

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#

Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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Nextflow Pipelines

Basic Pipeline Structure

// main.nf
nextflow.enable.dsl=2

params.reads = "data/*_{1,2}.fq.gz"
params.outdir = "res

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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