Nextflow Pipelines
Basic Pipeline Structure
// main.nf
nextflow.enable.dsl=2
params.reads = "data/*_{1,2}.fq.gz"
params.outdir = "res
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
Create scalable, containerized bioinformatics pipelines with Nextflow DSL2 supporting Docker, Singularity, and cloud execution. Use when building portable pipelines with container support, running workflows on cloud platforms (AWS, Google Cloud), or leveraging nf-core community pipelines.
/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
Para o autor da skill
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[](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-workflow-management-nextflow-pipelines?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)
Recursos para auxiliar na redação de comunicações internas em diversos formatos preferidos pela empresa. Claude deve usar esta habilidade para criar relatórios de status, atualizações de liderança, newsletters, FAQs e outros documentos internos.
Monitora um pull request ou ciclo de revisão até que esteja pronto para ser mesclado. Ideal para acompanhar comentários, revisões e CI de PRs até a resolução de todos os problemas.
Execute um plano de implementação faseado usando subagentes. Use quando solicitado a executar, rodar ou levar a cabo um plano — especialmente um criado por make-plan.
Busca estrutural de código otimizada por tokens usando parsing AST do tree-sitter. Utilize para entender a estrutura do código, encontrar funções ou explorar uma base de código de forma eficiente, sem a necessidade de ler arquivos completos.
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// main.nf
nextflow.enable.dsl=2
params.reads = "data/*_{1,2}.fq.gz"
params.outdir = "res
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]