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bio-workflows-atacseq-pipeline

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

End-to-end ATAC-seq workflow from FASTQ files to differential accessibility and TF footprinting. Covers alignment, peak calling with MACS3, QC metrics, and optional TOBIAS footprinting. Use when running end-to-end ATAC-seq analysis from FASTQ to differential accessibility.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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