bio-workflows-atacseq-pipeline

Name: bio-workflows-atacseq-pipeline
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

End-to-end ATAC-seq workflow from FASTQ files to differential accessibility and TF footprinting. Covers alignment, peak calling with MACS3, QC metrics, and optional TOBIAS footprinting. Use when running end-to-end ATAC-seq analysis from FASTQ to differential accessibility.

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Atualizado há 18 dias

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual

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