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bio-workflows-atacseq-pipeline

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

End-to-end ATAC-seq workflow from FASTQ files to differential accessibility and TF footprinting. Covers alignment, peak calling with MACS3, QC metrics, and optional TOBIAS footprinting. Use when running end-to-end ATAC-seq analysis from FASTQ to differential accessibility.

2estrelas
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Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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ATAC-seq Pipeline

Complete workflow from raw ATAC-seq FASTQ files to accessibility peaks, differential analysis, and TF footprinting.

Workflow O

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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