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bio-workflows-clip-pipeline

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

End-to-end CLIP-seq analysis from FASTQ to binding sites and motif enrichment. Use when analyzing protein-RNA interactions from CLIP-based methods.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

All Rights Reserved.

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This code is proprietary and confidential.

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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CLIP-seq Pipeline

Pipeline Overview

FASTQ → QC → UMI extract → Trim adapters → Align → Filter → Dedup → Peak call → Annotate → Motifs

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[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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