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bio-workflows-clip-pipeline

End-to-end CLIP-seq pipeline from FASTQ to ENCODE-compliant binding sites, single-nucleotide crosslink maps, annotation, motifs, and (optionally) differential binding. Use when running the full Yeo lab eCLIP / iCLIP / iCLIP2 / iCLIP3 / irCLIP / PAR-CLIP analysis with SMInput control, protocol-specific UMI extraction, ENCODE STAR parameters, CLIPper or Skipper peak calling with stringent log2 FC an

1estrellas
Actualizado hace 14 días

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Cómo agregar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-workflows-clip-pipeline-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-workflows-clip-pipeline-bg-szy?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

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