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bio-workflows-grn-pipeline

Dados e Análise Autor: bg-szy

End-to-end gene regulatory network inference pipeline from processed single-cell data to regulon discovery and perturbation simulation. Supports RNA-only (pySCENIC) and multiome (SCENIC+) paths. Use when building gene regulatory networks from single-cell transcriptomic or multiome data.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Gene Regulatory Network Pipeline

**"Infer gene regulatory netw

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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