bio-workflows-longread-sv-pipeline

Name: bio-workflows-longread-sv-pipeline
Author: bg-szy

Marketing

Autor: bg-szy

End-to-end workflow for detecting structural variants from long-read sequencing data. Covers ONT/PacBio alignment with minimap2 and SV calling with Sniffles or cuteSV. Use when detecting structural variants from long reads.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: bcftools 1.19+, minimap2 2.26+, samtools 1.19+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Long-Read SV Pipeline

**"Detect structural variants from my long-read sequencing data

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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