bio-workflows-tcr-pipeline

Name: bio-workflows-tcr-pipeline
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

End-to-end TCR/BCR repertoire analysis from FASTQ to clonotype diversity metrics. Use when analyzing immune repertoire sequencing data from bulk or single-cell experiments.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: MiXCR 4.6+, VDJtools 1.2.1+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

TCR/BCR Analysis Pipeline

"Analyze my TCR/BCR repertoire sequencing data end-to-end" -> Orchestrate

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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