biopython

Name: biopython
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Comprehensive molecular biology toolkit. Use for sequence manipulation, file parsing (FASTA/GenBank/PDB), phylogenetics, and programmatic NCBI/PubMed access (Bio.Entrez). Best for batch processing, custom bioinformatics pipelines, BLAST automation. For quick lookups use gget; for multi-service integration use bioservices.

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Atualizado há 15 dias

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Biopython: Computational Molecular Biology in Python

Overview

Biopython is a comprehensive set of freely available Python tools for biological computation. It provides functionality for sequence manipulation, file I/O, database access, structural bioinformatics, phylogenetics, and many other bioinformatics tasks. The current version is Biopython 1.87 (released March 2026). It requires Python 3.10+ and NumPy.

When to Use This Skill

Use this skill when:

Working with biologic

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