biopython-databases

Name: biopython-databases
Author: Pavel-Kravchenko

Dados e Análise

Autor: Pavel-Kravchenko

Integração com BioPython Seq/SeqRecord/SeqIO, API Entrez do NCBI, consultas UniProt e conversão de formatos biológicos.

3estrelas

Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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#ai #api #python

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BioPython — Biological Databases

Use when: fetching sequences/annotations from NCBI/UniProt/PDB/Ensembl; reading/writing FASTA, GenBank, EMBL, FASTQ; manipulating sequences (complement, translate, GC%, ORF finding); batch downloading records programmatically.

Quick Reference

NCBI Accession Prefixes

| Prefix | Type | DB | |--------|------|----| | NM_ | curated mRNA | RefSeq | | NR_ | curated ncRNA | RefSeq | | NP_ | curated protein | RefSeq | | NC_ | complete chromosome | RefSeq |

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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