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busco-phylogeny

Escrita e Conteúdo Autor: bg-szy

Gera filogenias a partir de montagens de genomas usando ortólogos de cópia única baseados em BUSCO/compleasm, com geração de fluxo de trabalho ciente do agendador.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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BUSCO-based Phylogenomics Workflow Generator

This skill provides phylogenomics expertise for generating comprehensive, scheduler-aware workflows for phylogenetic inference from genome assemblies using single-copy orthologs.

Purpose

This skill helps users generate phylogenies from genome assemblies by:

  1. Handling mixed input (local files and NCBI accessions)
  2. Creating scheduler-specific scripts (SLURM, PBS, cloud, local)
  3. Setting up complete workflows from raw genomes to final trees

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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