busco-status-interpretation

Name: busco-status-interpretation
Author: bg-szy

Design e Frontend

Autor: bg-szy

Guide to interpreting BUSCO completeness statuses: why Duplicated BUSCOs count as complete, parsing output files, computing/comparing completeness across proteomes/genomes, common counting mistakes. Use when running BUSCO QC, comparing assemblies, or reporting completeness. See also: prokka-genome-annotation for annotation workflows feeding BUSCO.

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BUSCO Status Interpretation Guide

Overview

BUSCO (Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs) is the standard tool for assessing genome, transcriptome, and proteome completeness by searching for conserved single-copy orthologs from the OrthoDB database. Correct interpretation of BUSCO output is essential for genome quality assessment, comparative genomics, and publication-ready reporting. The most common analytical error is excluding Duplicated BUSCOs from completeness counts, which art

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