cbioportal-database

Name: cbioportal-database
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Cancer genomics (TCGA et al.) via cBioPortal REST API. Retrieve somatic mutations, CNAs, expression, clinical data (survival/stage/treatment) across thousands of studies. Use for TMB, oncoprints, survival analysis. For population frequencies use gnomad-database; for drug-gene interactions use opentargets-database.

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Atualizado há 4 meses

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cBioPortal Database

Overview

cBioPortal for Cancer Genomics is a public repository of cancer genomics data including TCGA, ICGC, and hundreds of curated studies spanning 100+ cancer types. It provides somatic mutation profiles, copy number alterations (CNA), gene expression, clinical data (survival, stage, treatment history), and methylation data for tens of thousands of patient samples. Data is accessible via a REST API at https://www.cbioportal.org/api/ with no authentication required

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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