chipseq-epigenomics

Name: chipseq-epigenomics
Author: Pavel-Kravchenko

Dados e Análise

Autor: Pavel-Kravchenko

Pipeline de processamento ChIP-seq, incluindo chamada de picos com MACS3, análise de ligação diferencial com DiffBind, anotação de picos com ChIPseeker e visualização com deepTools.

3estrelas

Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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#ai

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ChIP-seq Epigenomics

When to Use

Use this skill when:

Processing ChIP-seq data (TF binding or histone modifications)
Calling narrow peaks (TF) or broad peaks (H3K4me3, H3K27ac, H3K27me3)
Running differential binding analysis between conditions
Annotating peaks to genomic features (promoter, intron, intergenic)
Visualizing signal enrichment with heatmaps and profile plots

Quick Reference

| Task | Tool | Key Command / Function | |------|------|----------------------| | Read

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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