cobrapy-metabolic-modeling

Name: cobrapy-metabolic-modeling
Author: bg-szy

Design e Frontend

Autor: bg-szy

Constraint-based (COBRA) analysis of genome-scale metabolic models: FBA, FVA, knockouts, flux sampling, production envelopes, gapfilling, media optimization. Use for strain design, essential gene ID, flux analysis. For kinetic modeling use tellurium; for visualization use Escher.

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Atualizado há 4 meses

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COBRApy — Constraint-Based Metabolic Modeling

Overview

COBRApy is a Python package for constraint-based reconstruction and analysis (COBRA) of genome-scale metabolic models. It provides flux balance analysis (FBA), flux variability analysis (FVA), gene and reaction knockout screens, flux sampling, production envelopes, gapfilling, and media optimization on SBML-format metabolic networks.

When to Use

Predicting microbial growth rates under different nutrient conditions (FBA)
Ident

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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