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datamol-cheminformatics

Dados e Análise Autor: bg-szy

Pythonic RDKit wrapper with sensible defaults for drug discovery. SMILES parsing, standardization, descriptors, fingerprints, similarity, clustering, diversity selection, scaffold analysis, BRICS/RECAP fragmentation, 3D conformers, and visualization. Returns native rdkit.Chem.Mol. Prefer datamol for standard workflows; use RDKit directly for advanced control.

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Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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#python

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Datamol Cheminformatics Toolkit

Overview

Datamol provides a lightweight, Pythonic abstraction layer over RDKit for molecular cheminformatics. It simplifies common drug discovery operations — SMILES parsing, standardization, descriptors, fingerprints, clustering, scaffolds, conformers, and visualization — with sensible defaults, built-in parallelization, and cloud storage support via fsspec. All molecular objects are native rdkit.Chem.Mol instances, ensuring full RDKit compatibility.

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[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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