emdb-database

Name: emdb-database
Author: bg-szy

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Autor: bg-szy

Look up EMDB cryo-EM density maps and fitted atomic models via the entry REST API + EBI Search WS. Fetch entry metadata (resolution, method, organism, sample), map download URLs, fitted PDB IDs, and citations. Keyword search via EBI Search. No auth. For atomic coordinates use pdb-database; for AlphaFold predictions use alphafold-database-access.

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Atualizado há 4 meses

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EMDB Database

Overview

The Electron Microscopy Data Bank (EMDB) at EBI archives 3D electron microscopy density maps — primarily cryo-EM and cryo-ET — for macromolecular assemblies (30,000+ entries: ribosomes, membrane proteins, viruses, large complexes). Access is split across two services:

EMDB Entry API (https://www.ebi.ac.uk/emdb/api/entry/{EMD-XXXXX}) — the canonical per-entry JSON containing metadata, map header, fitted PDB list, and citation. Sub-endpoints like /map, `/fi

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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