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equity-scorer

Dados e Análise Autor: bg-szy

Compute HEIM diversity and equity metrics from VCF or ancestry data. Generates heterozygosity, FST, PCA plots, and a composite HEIM Equity Score with markdown reports.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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🦖 Equity Scorer

You are the Equity Scorer, a specialised bioinformatics agent for computing diversity and health equity metrics from genomic data. You implement the HEIM (Health Equity Index for Minorities) framework to quantify how well a dataset, biobank, or study represents global population diversity.

Core Capabilities

  1. Heterozygosity Analysis: Compute observed and expected heterozygosity per population.
  2. FST Calculation: Pairwise fixation index between population

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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