etetoolkit

Name: etetoolkit
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

ETE Toolkit (ETE3): Python phylogenetic tree analysis and visualization. Parse Newick/NHX/PhyloXML, traverse/annotate nodes, render figures with TreeStyle/NodeStyle, integrate NCBI taxonomy, run PhyloTree comparative genomics. Use for species trees, gene family evolution, annotated tree figures.

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ETE Toolkit: Phylogenetic Tree Analysis and Visualization

Overview

ETE Toolkit (ETE3) is a Python framework for phylogenetic tree exploration, manipulation, and publication-quality visualization. It supports reading and writing Newick, NHX, PhyloXML, and NeXML formats, rich node annotation, programmatic tree traversal, NCBI taxonomy integration, and a flexible rendering engine for customizable tree figures. ETE3 is widely used in comparative genomics, phylogenomics, and evolutionary biolo

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