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Guide through omicverse's alignment module for SRA downloading, FASTQ quality control, STAR alignment, gene quantification, and single-cell kallisto/bustools pipelines covering both bulk and single-cell RNA-seq workflows.
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
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[](https://www.skillteca.com.br/skills/fastq-analysis-pipeline)
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利用AI大模型，一键生成高清短视频 Generate short videos with one click using AI LLM.
Automação
por harry0703
Creates an SVG weather card showing the current temperature for Dubai. Writes the SVG to orchestration-workflow/weather.svg and updates orchestration-workflow/output.md.
Automação
#ai
por shanraisshan
Automate Asana tasks via Rube MCP (Composio): tasks, projects, sections, teams, workspaces. Always search tools first for current schemas.
Automação
#git
#github
por sickn33
Integrate Stripe, PayPal, and payment processors. Handles checkout flows, subscriptions, webhooks, and PCI compliance. Use PROACTIVELY when implementing payments, billing, or subscription features.
Automação
#git
#github
por sickn33
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OmicVerse provides a complete FASTQ-to-count-matrix pipeline via the ov.alignment module. This skill covers:
SRA data acquisition : prefetch and fqdump (fasterq-dump wrapper)Quality control : fastp for adapter trimming and QC reportsRNA-seq alignment : STAR aligner with auto-index buildingGene quantification : featureCount (subread featureCounts wrapper)Single-cell path : ref and count via kb-python (kallisto/bustools)**Parallel SRA d [Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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