genomics-to-structure-triage

Name: genomics-to-structure-triage
Author: Pavel-Kravchenko

DevOps e Infra

Autor: Pavel-Kravchenko

Encaminha variantes genômicas priorizadas para acompanhamento estrutural no AlphaFold2/3 ou RoseTTAFold.

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Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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genomics-to-structure-triage

Model Routing

| Scenario | Preferred Model | |---|---| | Monomer baseline | AlphaFold2 | | Complex / nucleic acids / ligands | AlphaFold3 | | Rosetta-centric open workflows | RoseTTAFold |

def choose_structure_model(has_complex, has_ligand_or_nucleic, need_open_rosetta_workflow):
    if has_ligand_or_nucleic:
        return 'AlphaFold3'
    if need_open_rosetta_workflow:
        return 'RoseTTAFold'
    if has_complex:
        return 'AlphaFold3'
  

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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