histolab

Name: histolab
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Digital pathology image processing toolkit for whole slide images (WSI). Use this skill when working with histopathology slides, processing H&E or IHC stained tissue images, extracting tiles from gigapixel pathology images, detecting tissue regions, segmenting tissue masks, or preparing datasets for computational pathology deep learning pipelines. Applies to WSI formats (SVS, TIFF, NDPI), tile-bas

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Atualizado há 4 meses

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Histolab

Overview

Histolab is a Python library for processing whole slide images (WSI) in digital pathology. It automates tissue detection, extracts informative tiles from gigapixel images, and prepares datasets for deep learning pipelines. The library handles multiple WSI formats, implements sophisticated tissue segmentation, and provides flexible tile extraction strategies.

Installation

uv pip install histolab

Quick Start

Basic workflow for extracting tiles from a

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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