histolab-wsi-processing

Name: histolab-wsi-processing
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

WSI processing for digital pathology. Tissue detection, tile extraction (random, grid, score-based), filter pipelines for H&E/IHC. For dataset prep, tile-based DL, slide QC. Use pathml for multiplexed imaging.

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Atualizado há 4 meses

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Histolab WSI Processing

Overview

Histolab is a Python library for processing whole slide images (WSI) in digital pathology. It automates tissue detection, extracts informative tiles from gigapixel images using multiple strategies, and provides composable filter pipelines for preprocessing. The library handles SVS, TIFF, NDPI, and other WSI formats via OpenSlide.

When to Use

Extracting tiles from whole slide images for deep learning model training
Detecting tissue regions and filt

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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