imaging-data-commons

Name: imaging-data-commons
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Query and download NCI Imaging Data Commons (IDC) cancer radiology and pathology datasets via the idc-index Python client. No authentication required: the parquet index ships inside the pip wheel, SQL runs locally via DuckDB, and DICOM downloads stream from public S3/GCS buckets through s5cmd. Use sql_query() for DuckDB cohort selection, get_collections/get_patients/get_dicom_studies/get_dicom_ser

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#python #sql

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NCI Imaging Data Commons (idc-index)

Overview

NCI Imaging Data Commons (IDC) is the largest public collection of cancer imaging data, hosting 175+ DICOM collections (CT, MR, PET, slide microscopy, segmentations, structured reports). The idc-index Python client ships the entire IDC metadata catalog as a parquet file bundled inside the pip wheel; IDCClient() loads it into DuckDB, so sql_query() runs locally with zero network calls.

Image downloads stream from public AWS S3 (default) or Goo

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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